1. कई बार पेनिस में संक्रमण के कारण भी पेशाब करते वक्त काफी तेज जलन और दर्द होने लगता है। कई बार यह दर्द सेक्स के दौरान भी हो सकता है।
2. किटाणुओं की वजह से मूत्राशय में संक्रमण (जिसे "सिस्टाइटिस" कहते हैं; cystitis) होने के कारण भी लिंग में दर्द हो सकता है।
3. मूत्राशय में पथरी होने के वजह से भी यह दर्द उतपन्न हो सकता है।
4. कई बार शिश्न मुंड के ऊपर चमड़ी टाइट होने के वजह से भी यह दर्द उतपन्न हो सकता है।
5. कई बार पेनिस में दर्द का एक बड़ा कारण हस्तमैथुन भी होता है।